故事发生在一个占据东京都三分之一面积的巨大都市——学园都市，这里居住着230万人口，其中八成是学生。学园都市的所有学生都会接受超能力开发，通过药物、催眠术和通电刺激等方式获得超能力。能力者根据范围和威力被分为LV0至LV5。主角御坂美琴是学园都市中仅有的七位LV5之一，排名第三。她拥有操纵电击的超能力，被称为“电击使”，是电击能力的巅峰代表，因此被誉为“超电磁炮”。

        本作通过御坂美琴的视角，描绘了学园都市平凡而又不平凡的日常生活，同时也叙述了学园都市秘密进行非人道性质的实验，从而使大家对于本作及本篇《魔法禁书目录》的背景（世界观）的认识也慢慢变得清晰。

        在学园都市中，御坂美琴并不是唯一的超能力者，她的朋友们也都有着各自的特殊能力。白井黑子可以操纵机械，初春饰利可以改变气氛，佐天泪子可以控制水，春上衿衣可以隐形，婚后光子可以操纵光线，湾内绢保可以控制重力，泡浮万彬可以操纵气体，木山春生则是一位普通人。

        每个角色都有着自己的故事和成长经历，他们之间的关系也是故事的重要部分。通过角色之间的互动和冲突，故事不断地发展和推进。

        除了主角们的故事，本作也探讨了一些深刻的主题，例如道德、人性、科技和政治等。这些主题通过故事中的情节和角色的行为得到了生动的呈现，引发了观众的思考和讨论。

        总的来说，《魔法禁书目录》系列是一部充满魔幻和科幻元素的作品，它不仅有着精彩的故事和角色，还涉及了许多深刻的主题和问题。它的成功不仅在于其娱乐价值，更在于其思想性和启发性。